More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1677 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  850    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 414 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  40.53 
 
 		 446 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 432 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 413 aa  246  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  39.65 
 
 		 413 aa  236  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  34.75 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 423 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 401 aa  209  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 418 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  30.41 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  29.51 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  35.37 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  34.29 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.92 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 474 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  30.63 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  31.94 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 421 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 410 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  30.26 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 436 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 407 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  31.55 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 414 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  31.23 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 435 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 442 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  28.98 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 453 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  33.25 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  29.53 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  31.11 
 
 		 424 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  31.44 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  29.73 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 461 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.63 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4699  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6034  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  normal  0.0406983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 436 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 524 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 425 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 418 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  29.44 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2772  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  30.79 
 
 		 412 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5471  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 412 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5391  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 412 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667839  normal  0.033436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>