More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0331 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  100 
 
 
412 aa  824    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  52.94 
 
 
406 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  51.49 
 
 
446 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  50.13 
 
 
446 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  49.02 
 
 
413 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  49.02 
 
 
413 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  49.02 
 
 
413 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  51.35 
 
 
441 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 
419 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  47.68 
 
 
405 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  46.98 
 
 
402 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  46.81 
 
 
416 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 
404 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  52.38 
 
 
428 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  46.94 
 
 
412 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  47.89 
 
 
416 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  46.81 
 
 
418 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 
450 aa  346  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  41.15 
 
 
441 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 
456 aa  316  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  45.14 
 
 
450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  46.04 
 
 
452 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
428 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  39.29 
 
 
457 aa  292  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
419 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
426 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 
432 aa  279  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  42.02 
 
 
403 aa  265  8e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  40.32 
 
 
418 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  39.16 
 
 
414 aa  256  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 
424 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
425 aa  249  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 
420 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  36.75 
 
 
441 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  35.73 
 
 
413 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  38.85 
 
 
424 aa  240  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  37.81 
 
 
426 aa  237  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 
442 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  36.82 
 
 
426 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  37.08 
 
 
405 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
452 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 
453 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  36.41 
 
 
429 aa  226  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 
476 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  33.58 
 
 
430 aa  219  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  37.07 
 
 
450 aa  219  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 
435 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.7 
 
 
474 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
494 aa  213  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 
417 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 
421 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  37.17 
 
 
412 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 
436 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
415 aa  200  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.68 
 
 
403 aa  197  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  35.02 
 
 
440 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  34.38 
 
 
509 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  34.63 
 
 
447 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.74 
 
 
446 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  31.92 
 
 
426 aa  193  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 
418 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
431 aa  192  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
431 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 
475 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  34.16 
 
 
441 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  34.93 
 
 
418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  33.41 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
419 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
423 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  33.33 
 
 
429 aa  188  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  31.89 
 
 
431 aa  187  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
433 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 
432 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
442 aa  186  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  33.76 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
417 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  31.73 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  29.95 
 
 
410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  32.68 
 
 
428 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  32.62 
 
 
491 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
409 aa  179  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 
404 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  34.29 
 
 
429 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
410 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.15 
 
 
418 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
440 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  29.72 
 
 
424 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
453 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  28.92 
 
 
413 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 
412 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
421 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
414 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
401 aa  166  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  30.53 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  32.65 
 
 
474 aa  162  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  32.04 
 
 
413 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
413 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  31.66 
 
 
426 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>