More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1484 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  100 
 
 
406 aa  813    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  52.94 
 
 
412 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  49.75 
 
 
446 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  48.87 
 
 
446 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  49.75 
 
 
441 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 
419 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  47.01 
 
 
418 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  48.03 
 
 
416 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  48.03 
 
 
413 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  46.98 
 
 
412 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  48.03 
 
 
413 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  48.03 
 
 
413 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  48.95 
 
 
428 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  47.64 
 
 
404 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  46.98 
 
 
405 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  46.83 
 
 
416 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  45.29 
 
 
402 aa  348  8e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
456 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 
428 aa  322  7e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 
441 aa  322  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  41.67 
 
 
450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  42.12 
 
 
452 aa  309  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  38.81 
 
 
457 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 
461 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 
419 aa  296  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 
420 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 
426 aa  285  9e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  39.75 
 
 
414 aa  279  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 
432 aa  279  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  37.47 
 
 
413 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  40.99 
 
 
405 aa  276  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 
424 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  38.82 
 
 
424 aa  265  8e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 
403 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 
418 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  36.11 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  36.27 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  35.58 
 
 
509 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
425 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 
453 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  35.2 
 
 
426 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 
452 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  34.94 
 
 
426 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
475 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 
417 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  35.31 
 
 
450 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
435 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
494 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
421 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  33.07 
 
 
474 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  34.74 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 
415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 
423 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  34.46 
 
 
412 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  31.28 
 
 
426 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.83 
 
 
418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  31.51 
 
 
410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  32.58 
 
 
418 aa  183  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
410 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
418 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  32.59 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  32.4 
 
 
412 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  29.49 
 
 
403 aa  171  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.73 
 
 
446 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  30.52 
 
 
428 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
409 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  30.51 
 
 
413 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  28.06 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  30.61 
 
 
426 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.63 
 
 
474 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  31.54 
 
 
491 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  30.3 
 
 
447 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
433 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  28.36 
 
 
410 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
401 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
440 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 
419 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  33.25 
 
 
436 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
414 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  29.7 
 
 
429 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  30.13 
 
 
413 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  27.7 
 
 
413 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
412 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
440 aa  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  33.5 
 
 
425 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  30.02 
 
 
431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  30.73 
 
 
541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  28.46 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>