More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3881 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  82.66 
 
 		 475 aa  707    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  100 
 
 		 509 aa  1005    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 		 494 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  45.7 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  41.22 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  43.59 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  40.33 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  43.36 
 
 		 414 aa  290  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 		 431 aa  289  9e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 413 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 413 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 413 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 418 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 420 aa  286  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 456 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 450 aa  282  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 416 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  40.36 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  36.85 
 
 		 457 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 450 aa  276  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 418 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 416 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 402 aa  269  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.23 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 404 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 424 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 428 aa  264  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  42.13 
 
 		 405 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 425 aa  262  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 476 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  38.48 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  36.63 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 419 aa  252  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 406 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 429 aa  239  8e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 417 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 431 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 450 aa  223  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 426 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 412 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  35.68 
 
 		 426 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 412 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  32.58 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 474 aa  203  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  37.16 
 
 		 418 aa  191  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 417 aa  183  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 426 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.3 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 440 aa  177  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 404 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 436 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  29.55 
 
 		 424 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 413 aa  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0872  protein of unknown function DUF894 DitE  46.6 
 
 		 298 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  28.61 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 409 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 414 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  30.89 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  30.65 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  33.84 
 
 		 414 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>