More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0819 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 452 aa  878    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  59.19 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  51.74 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  53.75 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  51.01 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  48.18 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  48.8 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 446 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.52 
 
 		 446 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 413 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 413 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  54.99 
 
 		 429 aa  345  7e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  49.75 
 
 		 424 aa  343  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  46.98 
 
 		 403 aa  340  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 457 aa  340  4e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  48.41 
 
 		 476 aa  335  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  49.09 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  50.52 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  45.45 
 
 		 452 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  47.36 
 
 		 426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  50.13 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  47.96 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  48.01 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  46.24 
 
 		 441 aa  323  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  46.72 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  48.66 
 
 		 419 aa  319  5e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 418 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 416 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  48.38 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 		 426 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  50.79 
 
 		 412 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 		 442 aa  305  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  44.71 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  46.86 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 494 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  46.83 
 
 		 450 aa  296  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 		 417 aa  292  7e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 418 aa  253  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 431 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 406 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 475 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 412 aa  243  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  37.5 
 
 		 426 aa  239  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  42.05 
 
 		 418 aa  239  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 		 412 aa  239  9e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  35.71 
 
 		 430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 412 aa  222  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 474 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 447 aa  216  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  38.05 
 
 		 446 aa  209  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  37.77 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 413 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 428 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 378 aa  196  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  32.82 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 441 aa  193  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 415 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 440 aa  193  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  32.69 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 		 421 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  36.56 
 
 		 414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 404 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  32.49 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.03 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  30.29 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 410 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>