More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0110 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  100 
 
 
429 aa  837    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  54.3 
 
 
418 aa  358  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  49 
 
 
413 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 
419 aa  352  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 
450 aa  347  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 
424 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 
456 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 
461 aa  329  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 
441 aa  328  9e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  54.99 
 
 
452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  48.09 
 
 
416 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  47.87 
 
 
402 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  46.97 
 
 
413 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 
446 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  45.83 
 
 
450 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  46.04 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  46.28 
 
 
405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  47.73 
 
 
413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  47.73 
 
 
413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  46.85 
 
 
412 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.48 
 
 
446 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  45.59 
 
 
414 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  47.73 
 
 
416 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  46.01 
 
 
452 aa  313  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  43.9 
 
 
424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 
403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  47.16 
 
 
405 aa  310  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  48.12 
 
 
417 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  45.94 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  43.64 
 
 
418 aa  305  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  44.33 
 
 
432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
425 aa  302  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 
419 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  42.24 
 
 
420 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 
442 aa  299  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  46.09 
 
 
426 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 
431 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  46.15 
 
 
412 aa  295  9e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 
476 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 
404 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  45.21 
 
 
441 aa  289  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  42.43 
 
 
426 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  42.93 
 
 
426 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  45.28 
 
 
428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 
494 aa  277  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 
435 aa  272  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
436 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  36.7 
 
 
412 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  43.56 
 
 
450 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  40.15 
 
 
418 aa  256  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  37.04 
 
 
509 aa  249  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  36.15 
 
 
406 aa  249  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
431 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  39.73 
 
 
429 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  34.26 
 
 
418 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 
421 aa  242  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  37.03 
 
 
430 aa  241  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  35.42 
 
 
426 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  36.07 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
475 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  41.85 
 
 
491 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
453 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 
412 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 
433 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 
378 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  36.61 
 
 
474 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
415 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  36.27 
 
 
446 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
409 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 
440 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  34.54 
 
 
474 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  36.49 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  37.96 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  34.6 
 
 
447 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 
442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
423 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  33.98 
 
 
431 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 
421 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
440 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  34.75 
 
 
436 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  30.1 
 
 
410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  37.47 
 
 
413 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 
404 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  32.45 
 
 
424 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  35.68 
 
 
426 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 
428 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  29.4 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
423 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  38.15 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  33.75 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  33.68 
 
 
424 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
414 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  39.69 
 
 
425 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  33.51 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>