More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3320 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  809    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  76.85 
 
 		 428 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  53.87 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 475 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  44.59 
 
 		 431 aa  276  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 442 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 		 494 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 461 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 457 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 		 419 aa  262  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  40.35 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 420 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.79 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 428 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  40 
 
 		 418 aa  242  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  39.9 
 
 		 413 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 413 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 413 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  38.35 
 
 		 441 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  40.84 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  43.58 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 416 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  39.68 
 
 		 452 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  39.28 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 432 aa  216  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  33.66 
 
 		 426 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  38.06 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 		 426 aa  193  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 474 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 418 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  34.13 
 
 		 424 aa  176  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  32.44 
 
 		 430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 447 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 426 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  34.53 
 
 		 446 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 440 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 474 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 423 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  31.56 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 415 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  30.02 
 
 		 431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 426 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 378 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  26.92 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 410 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  30.62 
 
 		 423 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  30.43 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 413 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  29.24 
 
 		 553 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0872  protein of unknown function DUF894 DitE  39.81 
 
 		 298 aa  131  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>