More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0872 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0872  protein of unknown function DUF894 DitE  100 
 
 		 298 aa  578  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  60.19 
 
 		 435 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  51.69 
 
 		 405 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  50.7 
 
 		 450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  48.42 
 
 		 450 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 491 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  48.65 
 
 		 413 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.37 
 
 		 446 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 		 441 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  41.7 
 
 		 446 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  48.17 
 
 		 476 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  46.7 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  50.68 
 
 		 414 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 		 402 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  49.09 
 
 		 461 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  48.84 
 
 		 442 aa  175  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 436 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  49.28 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  47.57 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  51.56 
 
 		 452 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  42.8 
 
 		 441 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  46.6 
 
 		 509 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  48.56 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  48.21 
 
 		 456 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  52.17 
 
 		 418 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 		 426 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  44.71 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 494 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  35.22 
 
 		 412 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 431 aa  165  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  45.19 
 
 		 418 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  44.98 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  47.34 
 
 		 424 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  44.14 
 
 		 416 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 457 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  43.96 
 
 		 432 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 418 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  44.59 
 
 		 416 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 420 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 412 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 474 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 414 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 418 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  37.62 
 
 		 430 aa  155  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 425 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 428 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 413 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 423 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  46.32 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  42.23 
 
 		 446 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 474 aa  148  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 433 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 441 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 431 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  45.83 
 
 		 429 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 453 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  40.57 
 
 		 426 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 413 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 421 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 426 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 414 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 441 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 414 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  44.66 
 
 		 414 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  38.84 
 
 		 415 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 		 421 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 447 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 		 452 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  44.15 
 
 		 426 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 432 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 428 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 412 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 410 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  29.49 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 		 440 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 409 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  40.43 
 
 		 431 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 		 404 aa  125  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  34.47 
 
 		 424 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 413 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>