More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2848 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
426 aa  827    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  63.59 
 
 
450 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  65.62 
 
 
441 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  66.51 
 
 
456 aa  541  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  67.54 
 
 
432 aa  529  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  64.86 
 
 
452 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  54.42 
 
 
428 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  53.1 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 
446 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  51.15 
 
 
457 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  47.64 
 
 
446 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  50.98 
 
 
419 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 
419 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 
402 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  53.08 
 
 
418 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  50.13 
 
 
413 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  50.13 
 
 
413 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  48.52 
 
 
413 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  49.6 
 
 
405 aa  359  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  50.67 
 
 
416 aa  358  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  49.74 
 
 
416 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  50.13 
 
 
412 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  48.89 
 
 
418 aa  352  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  48.03 
 
 
441 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  47.77 
 
 
404 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  46.98 
 
 
420 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  47.51 
 
 
428 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 
424 aa  336  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  45.36 
 
 
413 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 
461 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  48.04 
 
 
476 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  46.92 
 
 
414 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  43.93 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 
403 aa  312  6.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 
425 aa  302  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  38.62 
 
 
406 aa  302  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 
452 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 
442 aa  300  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  45.55 
 
 
429 aa  296  5e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  40.9 
 
 
412 aa  294  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 
417 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  45.1 
 
 
405 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  40.1 
 
 
426 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  39.09 
 
 
426 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 
431 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  42.35 
 
 
450 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  41.01 
 
 
441 aa  270  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 
435 aa  262  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  41.91 
 
 
509 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  43.73 
 
 
412 aa  257  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 
494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 
436 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 
475 aa  245  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  41.26 
 
 
491 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  36.6 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  36.57 
 
 
412 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 
421 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  34.99 
 
 
430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
442 aa  220  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  39.3 
 
 
429 aa  219  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
433 aa  213  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  33 
 
 
418 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  38.01 
 
 
413 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 
412 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
410 aa  209  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  37.27 
 
 
418 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
440 aa  209  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  34.74 
 
 
474 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  35.86 
 
 
436 aa  203  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  35.43 
 
 
446 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 
415 aa  200  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  36.58 
 
 
441 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
418 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  38.59 
 
 
426 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
440 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
409 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
421 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  34.75 
 
 
447 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  34.84 
 
 
428 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  36.68 
 
 
413 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 
432 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  33.16 
 
 
424 aa  183  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  34.92 
 
 
474 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  34.11 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  35.79 
 
 
410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  28.64 
 
 
403 aa  180  4e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  34.85 
 
 
431 aa  180  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  35.53 
 
 
426 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  33.51 
 
 
424 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
423 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  31.03 
 
 
410 aa  176  9e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 
423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
378 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
413 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 
453 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>