More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2384 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  100 
 
 
441 aa  867    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  62.36 
 
 
446 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  58.03 
 
 
447 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  60.98 
 
 
440 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  51.8 
 
 
432 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  51.92 
 
 
419 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  49.64 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  48.63 
 
 
474 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 
413 aa  333  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  44.33 
 
 
409 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 
401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 
423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  39.59 
 
 
413 aa  302  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  37.44 
 
 
431 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
408 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  45.39 
 
 
414 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 
421 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  43.86 
 
 
414 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 
414 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  39.4 
 
 
423 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  41.67 
 
 
413 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 
412 aa  270  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 
414 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  38.98 
 
 
419 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  43.55 
 
 
474 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 
440 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  37.91 
 
 
436 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  42.74 
 
 
418 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  38.38 
 
 
430 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  40.25 
 
 
428 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  42.15 
 
 
413 aa  259  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  39.28 
 
 
435 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
442 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  38.17 
 
 
418 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  39.23 
 
 
412 aa  253  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  37.63 
 
 
410 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 
418 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 
435 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  38.77 
 
 
407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 
410 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
453 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  36.83 
 
 
426 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 
441 aa  223  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  33.94 
 
 
403 aa  219  6e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  35.2 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 
378 aa  216  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  37.53 
 
 
431 aa  216  8e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  35.06 
 
 
425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  35.06 
 
 
425 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  35.54 
 
 
418 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  33.6 
 
 
410 aa  212  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  36.83 
 
 
457 aa  209  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  34.72 
 
 
426 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 
418 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 
433 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 
405 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  35.51 
 
 
413 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 
461 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  37.73 
 
 
452 aa  204  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.12 
 
 
446 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  38.75 
 
 
450 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  35.9 
 
 
426 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  36.34 
 
 
413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 
419 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 
417 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  35.73 
 
 
413 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  35.73 
 
 
413 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 
424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  36.57 
 
 
416 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 
446 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  37 
 
 
414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  34.38 
 
 
424 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
425 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 
404 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  37.56 
 
 
429 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 
403 aa  194  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
420 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  35.38 
 
 
405 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  36.68 
 
 
441 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  37.23 
 
 
450 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
415 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  35.34 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 
417 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 
404 aa  189  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  34.08 
 
 
412 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  36.15 
 
 
416 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
417 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
442 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
476 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 
436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>