More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1327 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
433 aa  861    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 
453 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 
433 aa  247  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
412 aa  246  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  34 
 
 
430 aa  233  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  33.59 
 
 
412 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  35.51 
 
 
426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
440 aa  223  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  36.8 
 
 
418 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
440 aa  220  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.98 
 
 
436 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.83 
 
 
474 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  31.12 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  34.68 
 
 
441 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  35.38 
 
 
414 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  32.78 
 
 
474 aa  206  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  33.69 
 
 
407 aa  206  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  33.42 
 
 
446 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  32.26 
 
 
431 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  32.23 
 
 
413 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  35.25 
 
 
426 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  30.33 
 
 
424 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.45 
 
 
418 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
431 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
421 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
401 aa  194  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 
432 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
417 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
421 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  34.78 
 
 
414 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
414 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 
414 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  33.68 
 
 
414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  30.28 
 
 
447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
418 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  32.32 
 
 
413 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  32.07 
 
 
413 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33 
 
 
428 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 
378 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
450 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
415 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
423 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
413 aa  172  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 
494 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 
435 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 
461 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
417 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 
410 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 
441 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
404 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  32.45 
 
 
405 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
409 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  29.17 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  32.04 
 
 
424 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  30.63 
 
 
413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  30.63 
 
 
413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  30.89 
 
 
413 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  30.24 
 
 
403 aa  162  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  28.91 
 
 
410 aa  159  7e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  31.09 
 
 
535 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
432 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
456 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 
420 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
402 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  30.13 
 
 
416 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 
418 aa  156  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.76 
 
 
450 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
442 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  30.77 
 
 
412 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
476 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  27.25 
 
 
413 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  30.05 
 
 
426 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  29.67 
 
 
425 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  26.72 
 
 
423 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  31.12 
 
 
452 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  29.67 
 
 
425 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
408 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
424 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  32.05 
 
 
419 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  29.86 
 
 
405 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
428 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  29.96 
 
 
560 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  29.17 
 
 
429 aa  149  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  26.4 
 
 
414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  29.23 
 
 
410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  29.43 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
431 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
426 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  29.58 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  29.72 
 
 
457 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  29.92 
 
 
549 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  28.68 
 
 
435 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  29.46 
 
 
539 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.65 
 
 
446 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>