More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1700 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  88.78 
 
 
413 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  810    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  86.55 
 
 
416 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  89.02 
 
 
413 aa  725    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  87.62 
 
 
416 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  89.02 
 
 
413 aa  725    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  73.78 
 
 
402 aa  588  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  72.68 
 
 
405 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  69.52 
 
 
446 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  67.76 
 
 
446 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  67.53 
 
 
404 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  67.34 
 
 
441 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  64.65 
 
 
418 aa  501  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  66.13 
 
 
419 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  67.28 
 
 
428 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  53.3 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  56.53 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  46.48 
 
 
406 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  52.37 
 
 
456 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 
441 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  51.06 
 
 
428 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  46.94 
 
 
412 aa  372  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  51.05 
 
 
452 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  52.64 
 
 
419 aa  363  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  51.44 
 
 
457 aa  362  9e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 
426 aa  346  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
461 aa  345  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  48.28 
 
 
414 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  48.74 
 
 
413 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  52.56 
 
 
418 aa  341  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 
424 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 
432 aa  322  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  44.18 
 
 
420 aa  322  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
403 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  47.21 
 
 
424 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  47.75 
 
 
429 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 
452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 
442 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  48.01 
 
 
476 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  46.56 
 
 
405 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 
453 aa  279  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  41.46 
 
 
509 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  44.3 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  41.38 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  44.21 
 
 
426 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 
425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  41.16 
 
 
441 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 
436 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  44.41 
 
 
450 aa  259  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
494 aa  259  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 
417 aa  259  9e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 
435 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
475 aa  256  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  43.51 
 
 
412 aa  253  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  37.53 
 
 
429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
431 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  41.13 
 
 
491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  39.84 
 
 
418 aa  216  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
421 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  37.81 
 
 
413 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  34.55 
 
 
474 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  39.49 
 
 
474 aa  209  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  33.75 
 
 
412 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  33.17 
 
 
403 aa  208  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
423 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 
415 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  36.36 
 
 
426 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  33.33 
 
 
430 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
440 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
433 aa  205  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 
440 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  36.09 
 
 
428 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  35.41 
 
 
447 aa  203  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  35.34 
 
 
446 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  31.98 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 
442 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  34.57 
 
 
431 aa  197  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 
418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  32.34 
 
 
418 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 
404 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  33.75 
 
 
436 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  35.34 
 
 
441 aa  196  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
410 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  39.26 
 
 
426 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
419 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 
401 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  36.91 
 
 
413 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  32.07 
 
 
424 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 
421 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
417 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
453 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
409 aa  179  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
413 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
432 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  37.5 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  37.8 
 
 
426 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 
378 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  31.48 
 
 
410 aa  169  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>