More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 429 aa  844    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  52 
 
 		 428 aa  302  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 494 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 		 475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  53.39 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 450 aa  275  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 441 aa  257  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  39.41 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.56 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 457 aa  242  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 456 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  40.59 
 
 		 413 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 		 404 aa  236  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  38.89 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  37.63 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  42.31 
 
 		 424 aa  233  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 		 461 aa  233  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 418 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 432 aa  230  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 424 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  37.56 
 
 		 441 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 436 aa  219  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  40.57 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 425 aa  196  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 435 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 415 aa  186  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 442 aa  183  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 452 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  30.96 
 
 		 426 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 426 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 412 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  30.1 
 
 		 430 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  34.99 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 474 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  31.55 
 
 		 446 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  27.57 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 378 aa  149  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 423 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  30.19 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  29.29 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.49 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  30.18 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5404  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 419 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0872  protein of unknown function DUF894 DitE  45.83 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>