More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0420 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  820    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 421 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 415 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  31.81 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 418 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 413 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.59 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  29.55 
 
 		 412 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  30.03 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 429 aa  153  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 447 aa  153  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.74 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  28.54 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.79 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  28.65 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 450 aa  146  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  27.23 
 
 		 414 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 419 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  27.46 
 
 		 410 aa  144  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.35 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  30.81 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  28.57 
 
 		 424 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 450 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 419 aa  140  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.54 
 
 		 431 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.25 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  26.33 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 440 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.19 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 442 aa  133  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 453 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  25.71 
 
 		 541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 432 aa  126  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  25.13 
 
 		 425 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 414 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 425 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  26.7 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  27.29 
 
 		 542 aa  123  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  27.51 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 378 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 476 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>