More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0098 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
428 aa  842    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  45.45 
 
 
415 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  45.13 
 
 
524 aa  330  4e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  43.13 
 
 
415 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  34.96 
 
 
403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  33.98 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  33.99 
 
 
403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  32.93 
 
 
451 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  33.33 
 
 
415 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  35.08 
 
 
399 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  32.3 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  34.53 
 
 
474 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  32.93 
 
 
409 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
406 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
406 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  32.6 
 
 
406 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 
432 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  33.41 
 
 
410 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 
432 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  33.09 
 
 
428 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  31.97 
 
 
421 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  32.76 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  34.82 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
412 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
411 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  30.5 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  32.44 
 
 
416 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  31.41 
 
 
413 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  32.29 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  31.81 
 
 
420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  32.44 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  32.52 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  32.85 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  31.9 
 
 
413 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  35.41 
 
 
424 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 
406 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  32.68 
 
 
416 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
440 aa  193  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  33.57 
 
 
429 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  30.73 
 
 
424 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  29.44 
 
 
405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
416 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
449 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 
479 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  32.52 
 
 
499 aa  189  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  31.92 
 
 
415 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  30.92 
 
 
408 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  30.59 
 
 
427 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  32.58 
 
 
360 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  32.2 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  31.95 
 
 
416 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  31.95 
 
 
416 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  30.68 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 
427 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  32.31 
 
 
403 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
412 aa  180  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  31.41 
 
 
418 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  31.88 
 
 
408 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  31.88 
 
 
408 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  31.43 
 
 
437 aa  179  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 
397 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
447 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
406 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  33.68 
 
 
404 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
401 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  31.88 
 
 
408 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  35.2 
 
 
455 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  33.43 
 
 
414 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  31.8 
 
 
447 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  32.68 
 
 
416 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
443 aa  176  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 
438 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  27.36 
 
 
420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  30.71 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  30.36 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  29.34 
 
 
433 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  32.3 
 
 
421 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
406 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  29.68 
 
 
427 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
418 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  30.44 
 
 
433 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  30.46 
 
 
427 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  29.13 
 
 
431 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  28.94 
 
 
427 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  28.81 
 
 
443 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  32.46 
 
 
412 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  30.49 
 
 
401 aa  166  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  29.85 
 
 
404 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
432 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  31.91 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  29.85 
 
 
404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  29.1 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>