More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1023 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  796    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  796    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  99.02 
 
 		 408 aa  791    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  67.66 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  64.23 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  64.46 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  63.92 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  57.25 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  54.8 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  60.81 
 
 		 421 aa  398  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  53.06 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  50.76 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  52.85 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  52.85 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  52.85 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  52.61 
 
 		 409 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  57.11 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  57.11 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  53.42 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  52.91 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  53.83 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  53.79 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  55.33 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  51.26 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  52.25 
 
 		 479 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 		 411 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  52.32 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 		 416 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  51.15 
 
 		 406 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  49.11 
 
 		 451 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  48.86 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  53.56 
 
 		 360 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 416 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  47.74 
 
 		 408 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  50.51 
 
 		 416 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  48.75 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 415 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  47.98 
 
 		 412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  49.25 
 
 		 411 aa  318  9e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  45.94 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  48.15 
 
 		 423 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  49.74 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  53.4 
 
 		 424 aa  309  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  46.08 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  43.47 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  44.17 
 
 		 427 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  45.9 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  44.58 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 414 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  45 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  42.67 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  44.75 
 
 		 421 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  44.33 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  37.91 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  39.28 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 		 401 aa  249  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  38.89 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 411 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  37.85 
 
 		 414 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 418 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  38.54 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 415 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 428 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  31.68 
 
 		 431 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  32.45 
 
 		 505 aa  132  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>