More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2418 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
412 aa  791    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  50 
 
 
415 aa  356  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  51.89 
 
 
403 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
406 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  47.67 
 
 
419 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  49.39 
 
 
406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  50 
 
 
403 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  50.24 
 
 
406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  49.15 
 
 
409 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  47.07 
 
 
421 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  45.23 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  49.75 
 
 
412 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
411 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  49.36 
 
 
410 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  47.37 
 
 
405 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 
479 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  49.44 
 
 
360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  46.88 
 
 
408 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  49.1 
 
 
424 aa  319  6e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  44.19 
 
 
415 aa  319  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 
432 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 
432 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  46.72 
 
 
413 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  46.62 
 
 
416 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 
406 aa  316  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 
412 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 
420 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  46.38 
 
 
416 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  44.61 
 
 
422 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  44.9 
 
 
423 aa  308  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  47.9 
 
 
411 aa  308  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  45.41 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  44.97 
 
 
451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  44.2 
 
 
420 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  45.63 
 
 
416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 
406 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  42.89 
 
 
413 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  45.15 
 
 
416 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  45.15 
 
 
416 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 
406 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  45.54 
 
 
406 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  43.47 
 
 
428 aa  292  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  45.41 
 
 
410 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  44.23 
 
 
418 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  44.7 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  44.7 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  45.41 
 
 
415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  44.19 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  42.05 
 
 
414 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  41.13 
 
 
433 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  46.1 
 
 
416 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  41.79 
 
 
457 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  46.21 
 
 
429 aa  277  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  41.39 
 
 
427 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  41.81 
 
 
454 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  45.55 
 
 
404 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  43.52 
 
 
412 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  46.29 
 
 
424 aa  269  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  45.68 
 
 
421 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  38 
 
 
424 aa  264  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  40.46 
 
 
403 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  41.04 
 
 
427 aa  256  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  41.11 
 
 
437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  37.89 
 
 
427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  42.19 
 
 
410 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  44.1 
 
 
455 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  41.24 
 
 
499 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 
401 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 
415 aa  246  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  38.94 
 
 
399 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 
397 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  35.95 
 
 
425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  39.74 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  37.8 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  39.04 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  38.72 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
427 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  37.04 
 
 
414 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  40.41 
 
 
427 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  36.65 
 
 
418 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 
418 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 
416 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  35.73 
 
 
415 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 
414 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  35.49 
 
 
524 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
428 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  31.64 
 
 
415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  33.86 
 
 
431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
432 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
422 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  30.1 
 
 
418 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
445 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  29.1 
 
 
415 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  28.42 
 
 
474 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  31.04 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>