More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4706 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 445 aa  863    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  54 
 
 		 505 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  53 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  52.72 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  50.54 
 
 		 426 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  51.95 
 
 		 408 aa  348  9e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  47.71 
 
 		 422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 		 443 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  48.84 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  46.85 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  47.09 
 
 		 419 aa  316  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 		 438 aa  303  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 430 aa  294  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 430 aa  289  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 449 aa  286  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 423 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  39.77 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  39.29 
 
 		 450 aa  229  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  35.51 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 422 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  33.58 
 
 		 420 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 422 aa  189  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  34.04 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  33.78 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 524 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  30.21 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  29.93 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  30.96 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  30.69 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 406 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  29.59 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 416 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  28.61 
 
 		 419 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  30.52 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  35.01 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  26.63 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 415 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 410 aa  127  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 360 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  28.84 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 479 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 417 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 416 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  26.96 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 416 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 422 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 494 aa  116  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  26.75 
 
 		 424 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  26.11 
 
 		 421 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  27.03 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  28.54 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>