More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49890 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  100 
 
 
454 aa  885    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  77.43 
 
 
414 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  67.89 
 
 
427 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  66.67 
 
 
433 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  66.25 
 
 
457 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  69.59 
 
 
455 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  48.58 
 
 
423 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  46.88 
 
 
415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  46.47 
 
 
421 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  45.61 
 
 
415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
406 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  44.26 
 
 
440 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 
411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 
416 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  47 
 
 
405 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  40.8 
 
 
403 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  44.53 
 
 
419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  46.02 
 
 
413 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  45.7 
 
 
403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  44.96 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 
432 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 
432 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  45.14 
 
 
406 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  45.14 
 
 
406 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  46.67 
 
 
424 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  42.3 
 
 
451 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  44.2 
 
 
409 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 
420 aa  299  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  43 
 
 
410 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  44.14 
 
 
406 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  42.75 
 
 
420 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  45.07 
 
 
416 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  42.86 
 
 
428 aa  296  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 
412 aa  295  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  46.33 
 
 
413 aa  295  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  44.58 
 
 
412 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  44.58 
 
 
408 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  44.58 
 
 
408 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  44.5 
 
 
416 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  46.27 
 
 
408 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  43.95 
 
 
408 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  43.91 
 
 
416 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  46.67 
 
 
411 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  45.14 
 
 
410 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  47.75 
 
 
360 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  44.39 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  44.39 
 
 
416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  44.39 
 
 
416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 
406 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
412 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 
406 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  41.52 
 
 
406 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  45.45 
 
 
424 aa  272  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  45.77 
 
 
412 aa  270  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
479 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  37.5 
 
 
411 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  44.39 
 
 
416 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  44.11 
 
 
421 aa  259  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  41.81 
 
 
415 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  39.67 
 
 
499 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  40.65 
 
 
403 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  39.12 
 
 
418 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 
415 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  41.21 
 
 
404 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  42.82 
 
 
429 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 
397 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  37.56 
 
 
414 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  38.08 
 
 
418 aa  240  4e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  36.77 
 
 
437 aa  240  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  37.56 
 
 
399 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  39.85 
 
 
427 aa  236  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  38 
 
 
410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  36.78 
 
 
424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 
427 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
401 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  37.56 
 
 
427 aa  229  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  37.56 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  37.14 
 
 
421 aa  226  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  36.41 
 
 
401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 
425 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  36.67 
 
 
427 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 
416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 
418 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
428 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  33.33 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  34.52 
 
 
524 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  32.74 
 
 
415 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  31.73 
 
 
431 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  27.36 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  32.48 
 
 
474 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  30.7 
 
 
419 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
443 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  31.68 
 
 
426 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  29.55 
 
 
418 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
447 aa  126  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
419 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>