More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4646 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  98.02 
 
 
406 aa  782    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  93.33 
 
 
406 aa  723    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  98.02 
 
 
406 aa  781    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  100 
 
 
409 aa  805    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  85.89 
 
 
412 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  80.1 
 
 
403 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  79.1 
 
 
403 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  57.97 
 
 
415 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  57.87 
 
 
406 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  52.71 
 
 
422 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  52.87 
 
 
403 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  54.99 
 
 
406 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  56.39 
 
 
479 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  56.58 
 
 
419 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  54.88 
 
 
424 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  51.96 
 
 
420 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  54.84 
 
 
432 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  51.26 
 
 
451 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  52.99 
 
 
418 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  53.09 
 
 
420 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  52.88 
 
 
416 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  52.63 
 
 
416 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  54.84 
 
 
432 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  51 
 
 
440 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  52.61 
 
 
408 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  52.61 
 
 
408 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  52.36 
 
 
408 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  51.72 
 
 
408 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  51.88 
 
 
416 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  52.27 
 
 
405 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  52.13 
 
 
416 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  55.41 
 
 
397 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  51.88 
 
 
416 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  51.88 
 
 
416 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  53.07 
 
 
415 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 
406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 
406 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  55.49 
 
 
360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  53.59 
 
 
410 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  51.99 
 
 
411 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  52.24 
 
 
421 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  48.87 
 
 
421 aa  349  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  51.01 
 
 
412 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  51.26 
 
 
416 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 
411 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  51.74 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  52.45 
 
 
424 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  42.64 
 
 
415 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  44.7 
 
 
413 aa  319  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  45.48 
 
 
410 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  45.87 
 
 
423 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  47.47 
 
 
413 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  45.04 
 
 
428 aa  312  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  42.93 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  43.18 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  44.64 
 
 
454 aa  302  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  43.7 
 
 
457 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  43 
 
 
414 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  44.44 
 
 
412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  44.72 
 
 
429 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  42.61 
 
 
403 aa  277  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  39.27 
 
 
411 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  43.28 
 
 
399 aa  272  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  45.66 
 
 
455 aa  272  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  39.86 
 
 
424 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
401 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  41.73 
 
 
414 aa  266  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
425 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  44.25 
 
 
499 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  42.57 
 
 
427 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  42.23 
 
 
418 aa  259  4e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  41.27 
 
 
427 aa  260  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  40.26 
 
 
407 aa  259  7e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  39.7 
 
 
401 aa  259  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  41.92 
 
 
421 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  43.03 
 
 
437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 
427 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  39.69 
 
 
427 aa  253  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 
415 aa  252  7e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 
416 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  39.59 
 
 
410 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 
418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
428 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  37.5 
 
 
415 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.99 
 
 
415 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  35.25 
 
 
524 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  32.89 
 
 
474 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  30.05 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
422 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  31.61 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
449 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  30.79 
 
 
404 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
445 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  33.25 
 
 
430 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
447 aa  136  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  32.72 
 
 
430 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>