More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3555 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
449 aa  844    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  58.94 
 
 
438 aa  435  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  60.04 
 
 
450 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  55.87 
 
 
423 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  52.74 
 
 
447 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  57.08 
 
 
423 aa  388  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  59.86 
 
 
427 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  47.22 
 
 
415 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  46.06 
 
 
419 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  46.76 
 
 
438 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  46.39 
 
 
443 aa  286  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 
445 aa  286  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  44.81 
 
 
430 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
422 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  44.44 
 
 
426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  42.36 
 
 
505 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  46.1 
 
 
430 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
426 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  38.9 
 
 
443 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 
408 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 
436 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  48.28 
 
 
343 aa  228  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 
426 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  37.78 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
428 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
422 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  34.47 
 
 
415 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 
445 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  33.86 
 
 
524 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  32.52 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  35.27 
 
 
420 aa  170  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  31.8 
 
 
404 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.91 
 
 
415 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
401 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
420 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
440 aa  143  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  30.94 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  30.51 
 
 
412 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  31.65 
 
 
451 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  29.11 
 
 
406 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  28.86 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  31.54 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  29.5 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  33.76 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  29.59 
 
 
403 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  31 
 
 
437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  31.7 
 
 
401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  33.75 
 
 
416 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  31.22 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  31.33 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  29.67 
 
 
403 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  33.17 
 
 
416 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  33.17 
 
 
416 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  33.17 
 
 
416 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  32.76 
 
 
416 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  29.26 
 
 
421 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  32.35 
 
 
416 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  29.24 
 
 
424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  28.74 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  27.7 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  31.73 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  28.78 
 
 
426 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  34.07 
 
 
416 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  29.06 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  32.9 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  27.27 
 
 
403 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  29.01 
 
 
423 aa  117  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
427 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  27.03 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.57 
 
 
474 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  32.57 
 
 
411 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  28.09 
 
 
454 aa  113  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
419 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
412 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  29.95 
 
 
429 aa  113  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  30.43 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  28.12 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  29.46 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  28.14 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  27.39 
 
 
399 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  29.87 
 
 
407 aa  111  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  29.46 
 
 
408 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  29.46 
 
 
408 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  28.07 
 
 
421 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  30.47 
 
 
421 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>