More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5278 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  789    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  71.61 
 
 		 405 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  52.39 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  54.36 
 
 		 406 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  51.88 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  53.52 
 
 		 479 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  52.13 
 
 		 403 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  52.01 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  51.76 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  52.21 
 
 		 406 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 409 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  53.1 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  56.9 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  51.88 
 
 		 420 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  52.61 
 
 		 406 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  52.26 
 
 		 416 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  52.01 
 
 		 416 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  46.93 
 
 		 411 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  49.76 
 
 		 419 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  50.75 
 
 		 412 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 		 416 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  47.86 
 
 		 403 aa  345  7e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  47.98 
 
 		 422 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  50.48 
 
 		 416 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  50 
 
 		 416 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  50 
 
 		 416 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  52.04 
 
 		 432 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  52.04 
 
 		 432 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 		 406 aa  332  7.000000000000001e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  51.53 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 413 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  51.01 
 
 		 416 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 418 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  52.96 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  48.01 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 		 412 aa  315  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  47.74 
 
 		 408 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  47.74 
 
 		 408 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  47 
 
 		 410 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  47.75 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  44.47 
 
 		 410 aa  302  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  44.86 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  44.83 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  48.21 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 414 aa  292  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  47.62 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 411 aa  289  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  45.25 
 
 		 454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 403 aa  273  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  45.75 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  42.24 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 437 aa  247  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  35.82 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 427 aa  236  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  42.78 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  42.15 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 401 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  36.84 
 
 		 407 aa  222  8e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 401 aa  222  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  36.34 
 
 		 427 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  35.42 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  34.89 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 414 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 524 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3166  hypothetical protein  57.48 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610941  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  31.94 
 
 		 431 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 445 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 447 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 474 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 447 aa  112  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.57 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>