More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0513 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  100 
 
 
430 aa  801    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  90.91 
 
 
430 aa  680    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  56.93 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  53.9 
 
 
419 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  57.25 
 
 
443 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 
426 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  46.72 
 
 
505 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 
445 aa  312  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 
422 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 
436 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  45.99 
 
 
449 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  42.59 
 
 
443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  43.76 
 
 
450 aa  264  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  42.69 
 
 
426 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 
447 aa  260  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 
443 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 
408 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 
423 aa  259  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  44.26 
 
 
438 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 
438 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  46.11 
 
 
423 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 
427 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 
426 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  41.09 
 
 
431 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  35.1 
 
 
420 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 
422 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  33.33 
 
 
404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 
388 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  32.43 
 
 
415 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  33.59 
 
 
404 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  29.65 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  31.94 
 
 
524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.76 
 
 
415 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  31.92 
 
 
415 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  33.25 
 
 
406 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  32.99 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 
416 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 
406 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  32.47 
 
 
406 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  31.42 
 
 
413 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  32.24 
 
 
403 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  34.68 
 
 
410 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
420 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  30.81 
 
 
451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  30.69 
 
 
420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  32.25 
 
 
403 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  31.05 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  30.26 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  33.77 
 
 
424 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  31.88 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  31.28 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  35.28 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  28.72 
 
 
421 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  30.37 
 
 
428 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  28.38 
 
 
410 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 
425 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  32.32 
 
 
360 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  29.43 
 
 
421 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  35.9 
 
 
343 aa  124  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  31.74 
 
 
454 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  24.36 
 
 
424 aa  123  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 
406 aa  123  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.2 
 
 
419 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  32.47 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  30.56 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.93 
 
 
416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  29.92 
 
 
432 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  29.9 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  27.86 
 
 
403 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
412 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  31.4 
 
 
424 aa  120  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  29.34 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  33.42 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  29.35 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  30.05 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  29.74 
 
 
427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  29.4 
 
 
414 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
406 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  25.88 
 
 
427 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  28.85 
 
 
416 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  28.85 
 
 
416 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  31.42 
 
 
412 aa  116  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  26.84 
 
 
427 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  28.53 
 
 
424 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
401 aa  113  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  32.35 
 
 
404 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  26.19 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>