More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0425 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  100 
 
 
430 aa  796    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  90.91 
 
 
430 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  56.93 
 
 
415 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  58.57 
 
 
443 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  54.33 
 
 
419 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  48.68 
 
 
505 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  46.93 
 
 
426 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
445 aa  312  6.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 
422 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 
436 aa  300  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  45.52 
 
 
449 aa  286  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  44.36 
 
 
426 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 
408 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  44.76 
 
 
450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  42.34 
 
 
443 aa  269  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 
443 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  42.07 
 
 
447 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 
438 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 
438 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 
423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 
427 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  46.37 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  41.86 
 
 
431 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 
422 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  35.45 
 
 
420 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
422 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  32.91 
 
 
404 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 
428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  33.17 
 
 
404 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 
388 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  32.52 
 
 
415 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  29.8 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  33.25 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  33.5 
 
 
415 aa  146  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  31.94 
 
 
524 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  33.25 
 
 
406 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
406 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  33 
 
 
406 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  32.42 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  31.95 
 
 
420 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
422 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
416 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  32.41 
 
 
403 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  30.92 
 
 
413 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
420 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  34.56 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  30.2 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  32.02 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  32.16 
 
 
403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 
440 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 
406 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  30.22 
 
 
451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  33.17 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 
479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  30.53 
 
 
415 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  32.38 
 
 
437 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  28.75 
 
 
421 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
432 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
432 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
406 aa  126  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  33.7 
 
 
421 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  31 
 
 
416 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  32.34 
 
 
454 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  30.81 
 
 
427 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  30.65 
 
 
408 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  30.37 
 
 
416 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  33.33 
 
 
424 aa  123  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  30.75 
 
 
416 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  28.35 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  31.25 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  27.49 
 
 
427 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  29.95 
 
 
416 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  35.37 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  26.52 
 
 
433 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  29.46 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  29.46 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  23.96 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.32 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  28.25 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  34.01 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  32.41 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  29.77 
 
 
414 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  29.32 
 
 
432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  29.97 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  29.89 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  30.67 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  31.25 
 
 
424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  29.49 
 
 
423 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  25.26 
 
 
427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  26.3 
 
 
403 aa  113  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  33.24 
 
 
415 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>