More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3197 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
427 aa  807    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  62.79 
 
 
438 aa  465  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  64.8 
 
 
450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  57.66 
 
 
447 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  59.86 
 
 
449 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  51.05 
 
 
423 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  53.15 
 
 
423 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  47.62 
 
 
415 aa  312  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  49.53 
 
 
443 aa  292  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  45.97 
 
 
419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 
445 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 
422 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  47.04 
 
 
430 aa  273  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  43.19 
 
 
426 aa  264  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  46.21 
 
 
430 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  43.03 
 
 
505 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  42.6 
 
 
408 aa  242  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 
426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  39.86 
 
 
443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  43.45 
 
 
436 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 
443 aa  216  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 
426 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
422 aa  209  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  46.03 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  36.41 
 
 
431 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.2 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 
422 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  33.08 
 
 
524 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  31.19 
 
 
420 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  29.86 
 
 
404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  29.86 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  40.64 
 
 
445 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 
388 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  28.33 
 
 
415 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  27.58 
 
 
409 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  28.35 
 
 
406 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
412 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  29.05 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.85 
 
 
419 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  29.15 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  28.79 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  29.7 
 
 
451 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  32.32 
 
 
416 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  27.34 
 
 
412 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 
479 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  29.68 
 
 
415 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  32.07 
 
 
416 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  31.02 
 
 
420 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
420 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  27.72 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  32.07 
 
 
416 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  29.66 
 
 
429 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  31.92 
 
 
411 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  29.63 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.63 
 
 
424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  26.7 
 
 
424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  30.81 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  31.39 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  31.49 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.8 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.14 
 
 
415 aa  116  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  25.12 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  29.7 
 
 
405 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  28.53 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.47 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  27.27 
 
 
437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  30.96 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  30.9 
 
 
416 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.81 
 
 
474 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.04 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  29.35 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  30.9 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  30.9 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  30.24 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  25.59 
 
 
424 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.84 
 
 
447 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  28.5 
 
 
426 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  29.52 
 
 
408 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  25.13 
 
 
427 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  26.38 
 
 
433 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
415 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  28.4 
 
 
413 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>