More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0832 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 443 aa  828    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  49.41 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  48.27 
 
 		 505 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 426 aa  310  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  48.07 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  52.06 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  48.66 
 
 		 408 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  44.87 
 
 		 422 aa  294  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  45.11 
 
 		 415 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 438 aa  292  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  45.63 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  44.14 
 
 		 449 aa  282  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 443 aa  275  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 423 aa  272  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 430 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  49.08 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  42.27 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  37.35 
 
 		 420 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 422 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  42.96 
 
 		 427 aa  216  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  33.91 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  34.4 
 
 		 404 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  38.96 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 524 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  31.85 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 420 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 420 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  31.3 
 
 		 412 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  29.82 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.14 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  31.81 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  32.39 
 
 		 424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 416 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  31.63 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  30.25 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 416 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 411 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  30.05 
 
 		 433 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  28.33 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 406 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 421 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 427 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  28.1 
 
 		 424 aa  132  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  30.89 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 401 aa  127  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  31 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 415 aa  126  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  26.99 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  31.6 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  28.46 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  26.8 
 
 		 424 aa  120  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  30.17 
 
 		 426 aa  120  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 360 aa  119  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  30.97 
 
 		 455 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  30.16 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>