More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1264 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
422 aa  811    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  66.98 
 
 
426 aa  504  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  63.16 
 
 
408 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  55.58 
 
 
505 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  53.38 
 
 
426 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  50.47 
 
 
436 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  47.71 
 
 
445 aa  358  7e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  44.82 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  45.22 
 
 
415 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  48.43 
 
 
443 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  43.19 
 
 
419 aa  295  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 
423 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  42.45 
 
 
430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
449 aa  277  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  42.69 
 
 
430 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  44.63 
 
 
443 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  41.4 
 
 
450 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
447 aa  256  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 
438 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 
427 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  42.75 
 
 
423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  32.53 
 
 
420 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
422 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 
422 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
426 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  32.14 
 
 
431 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  29.69 
 
 
524 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  30.58 
 
 
415 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
388 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
428 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  31.23 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  29.43 
 
 
404 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  29.43 
 
 
404 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.04 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  26.65 
 
 
421 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  27.27 
 
 
419 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
412 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  33.1 
 
 
426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  34.84 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  29.66 
 
 
424 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  30 
 
 
432 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
411 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  27.45 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  26.76 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  27.02 
 
 
427 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
479 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  24.32 
 
 
403 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 
453 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  25.6 
 
 
413 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
440 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
432 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
432 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  25.37 
 
 
411 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  27.92 
 
 
424 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  28.57 
 
 
403 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  27.8 
 
 
403 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
422 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
442 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  27.58 
 
 
451 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
401 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
415 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  29.62 
 
 
443 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
417 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  26.93 
 
 
412 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  23.91 
 
 
410 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  27.67 
 
 
403 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  25.52 
 
 
410 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  28 
 
 
406 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  26.59 
 
 
420 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  26.49 
 
 
416 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
420 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
417 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  24.65 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  26.34 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  25.26 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
433 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  26.76 
 
 
360 aa  97.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  24.2 
 
 
399 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  27.2 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
435 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  26.34 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.62 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.01 
 
 
436 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  26.07 
 
 
429 aa  93.2  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  27.21 
 
 
416 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  23.69 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  26.84 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  31.25 
 
 
586 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
406 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  26.53 
 
 
409 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  25.06 
 
 
428 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  23.53 
 
 
427 aa  90.5  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.45 
 
 
403 aa  90.1  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>