More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1399 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  100 
 
 		 360 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  66.86 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  57.75 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  59.27 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  59.15 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  58.19 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  58.19 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  59.27 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  58.99 
 
 		 420 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  56.46 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  60.85 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  61.13 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  61.13 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  59.27 
 
 		 420 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  51.67 
 
 		 403 aa  361  8e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  57.14 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  57.22 
 
 		 479 aa  358  6e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  56.9 
 
 		 408 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  53.09 
 
 		 422 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  56.5 
 
 		 416 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 416 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 416 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 406 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 416 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 416 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  55.49 
 
 		 406 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  55.49 
 
 		 409 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  55.84 
 
 		 403 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  54.21 
 
 		 406 aa  342  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  55.21 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  55.56 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  54.99 
 
 		 412 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  56.78 
 
 		 416 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  50.84 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  52.5 
 
 		 423 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  60.45 
 
 		 424 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 418 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  53.56 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  53.56 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  53.56 
 
 		 408 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  46.89 
 
 		 415 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  52.81 
 
 		 415 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  49.44 
 
 		 412 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  53.87 
 
 		 421 aa  309  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 		 411 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  52.71 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  49.72 
 
 		 428 aa  308  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  51.27 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  52.71 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  48.72 
 
 		 413 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  48.43 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  50.28 
 
 		 411 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  50.56 
 
 		 429 aa  288  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  47.75 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  43.38 
 
 		 410 aa  275  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  46.89 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  49 
 
 		 413 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 403 aa  272  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  44.2 
 
 		 433 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 427 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  48.43 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  44.94 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  47.53 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  41.37 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 499 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  40.06 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  37.53 
 
 		 424 aa  233  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  41.94 
 
 		 421 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 		 416 aa  229  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  42.98 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  39.11 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  40.65 
 
 		 427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 418 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  40 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 414 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 418 aa  192  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  35.92 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 524 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 415 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 447 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 426 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 449 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 412 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 422 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  32.14 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 422 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>