More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0691 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  100 
 
 
428 aa  832    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  49.63 
 
 
415 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  47.46 
 
 
415 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 
411 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 
416 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  48.72 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  48.08 
 
 
410 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  46 
 
 
413 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 
432 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 
432 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  48.03 
 
 
419 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  51.12 
 
 
411 aa  329  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  49.38 
 
 
413 aa  328  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  47.16 
 
 
423 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  48.62 
 
 
424 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  47.42 
 
 
421 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  48.53 
 
 
408 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 
412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  52.12 
 
 
429 aa  319  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  47.37 
 
 
422 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  46.42 
 
 
440 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  46.35 
 
 
410 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  46.55 
 
 
405 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  47.29 
 
 
403 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  48.15 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  46.3 
 
 
437 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 
406 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  49.72 
 
 
360 aa  308  9e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  42.2 
 
 
403 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 
420 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  46.31 
 
 
403 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  47.13 
 
 
414 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 
406 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  45.89 
 
 
406 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  45.41 
 
 
412 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  45.28 
 
 
406 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  45.04 
 
 
409 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  44.55 
 
 
412 aa  300  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  46.78 
 
 
416 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  45.91 
 
 
418 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  47.17 
 
 
406 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  45.39 
 
 
416 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  46.46 
 
 
416 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 
479 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  42.72 
 
 
433 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  43.76 
 
 
420 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  45.85 
 
 
457 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  45.52 
 
 
416 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  43.63 
 
 
427 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  45.99 
 
 
416 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  45.99 
 
 
416 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  44.96 
 
 
451 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  49.51 
 
 
424 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  42.86 
 
 
399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  44.17 
 
 
408 aa  285  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  44.42 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  44.42 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 
406 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  48.13 
 
 
421 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 
412 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  45.01 
 
 
404 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  42.86 
 
 
454 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 
406 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  47.7 
 
 
415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  38.3 
 
 
424 aa  274  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  46.78 
 
 
416 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  46.21 
 
 
455 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  40.66 
 
 
499 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  38.65 
 
 
427 aa  266  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  39.28 
 
 
411 aa  259  8e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  40.69 
 
 
421 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  40.68 
 
 
407 aa  249  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 
418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  38.41 
 
 
427 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 
415 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 
425 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  37.9 
 
 
414 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  36.83 
 
 
418 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  38.44 
 
 
410 aa  226  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 
401 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  37.31 
 
 
401 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  39.09 
 
 
414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  36.36 
 
 
415 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  34.32 
 
 
415 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
428 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  34.31 
 
 
524 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 
453 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  31.57 
 
 
474 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.5 
 
 
418 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  28.97 
 
 
407 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
440 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  31.89 
 
 
418 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  31.81 
 
 
431 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.66 
 
 
447 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  32.49 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.14 
 
 
426 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>