More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1693 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  823    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  54.29 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  40.5 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  40.25 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  38.71 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 426 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  37.41 
 
 		 505 aa  219  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  37.28 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 422 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 524 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  33.87 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  34.91 
 
 		 431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 406 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  30.98 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  30.71 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  32.63 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 411 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  30.12 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  31.25 
 
 		 405 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  28.71 
 
 		 399 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 403 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 410 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 428 aa  136  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.62 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  28.09 
 
 		 433 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 479 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 499 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 432 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 432 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  27.46 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  32.66 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  28.64 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 		 427 aa  126  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0363  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  30.4 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  27.7 
 
 		 421 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 408 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 408 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  30.66 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  25.06 
 
 		 424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  29.92 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  27.96 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  29.88 
 
 		 426 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  27.87 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  30.2 
 
 		 454 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>