More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1007 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  785    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  69.93 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  64.43 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  56.93 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  56.8 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  50.75 
 
 		 426 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  46.73 
 
 		 449 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 		 422 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  48.43 
 
 		 505 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  48.77 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 408 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 426 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  47.57 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 447 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  46.34 
 
 		 450 aa  289  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 423 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  44.09 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 		 443 aa  266  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 		 427 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  37.25 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  34.83 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 524 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 445 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  34.44 
 
 		 404 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  34.18 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  29.21 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 403 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.87 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  28.97 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 479 aa  133  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  27.52 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  30.18 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  37.33 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  27.23 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 420 aa  126  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 406 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  28.42 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  32.76 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  30.28 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 440 aa  123  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 416 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 416 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  28.38 
 
 		 412 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 410 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  27.11 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  28.65 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  30.65 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 414 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  27.15 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  26.92 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.79 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  28.97 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  26.99 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  28.79 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  26.28 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>