More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0850 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  790    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  63.16 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  64.42 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  58.09 
 
 		 505 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  53.9 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  54.57 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  52.2 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 443 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  49.88 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  47.06 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 		 443 aa  286  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 438 aa  279  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  43.41 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 447 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  36.63 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  33.41 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  31.95 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  33.68 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 524 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  37.37 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  30.91 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  27.92 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  30.21 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  30.7 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 416 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.26 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 415 aa  116  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  30.88 
 
 		 443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  28.87 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  25.38 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  27.85 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  30.68 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 494 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  29.92 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  27.15 
 
 		 421 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  29.41 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 417 aa  104  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  25.12 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  25.56 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  24.51 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  27.58 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  27.53 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.22 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>