More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1719 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
447 aa  863    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  62.13 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  57.14 
 
 
438 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  52.74 
 
 
449 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  57.66 
 
 
427 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  45.93 
 
 
423 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  48.87 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  42.92 
 
 
415 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  41.4 
 
 
419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  41.57 
 
 
438 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 
445 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  43.81 
 
 
443 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  39.1 
 
 
443 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  38.91 
 
 
422 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  41.38 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  40.66 
 
 
426 aa  243  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  41.38 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  39.71 
 
 
505 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 
426 aa  229  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 
443 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 
408 aa  221  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 
436 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 
426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  34.31 
 
 
420 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  41.77 
 
 
343 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  34.77 
 
 
431 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
428 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 
422 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
388 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 
420 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  30.19 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  30.82 
 
 
420 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  28.7 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  33.25 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.54 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  28.11 
 
 
412 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  28.01 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  29.01 
 
 
415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  27.61 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  29.16 
 
 
404 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
412 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  29.88 
 
 
416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
479 aa  136  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.65 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  29.41 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
401 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  27.52 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  27.42 
 
 
409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  28.11 
 
 
406 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  29.17 
 
 
416 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
440 aa  131  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  29.37 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
415 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  28.4 
 
 
419 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  28.94 
 
 
416 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  28.94 
 
 
416 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
406 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 
416 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  25.41 
 
 
403 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  27.49 
 
 
421 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  25.41 
 
 
433 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  27.52 
 
 
405 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  25.41 
 
 
427 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.67 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  30.05 
 
 
410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  29.28 
 
 
411 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  28.5 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  29.12 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  28.67 
 
 
416 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  27.79 
 
 
454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  26.54 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  27.75 
 
 
432 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  25.5 
 
 
426 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  27.83 
 
 
424 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  27.55 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  29.19 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  29.53 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  27.01 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  27.46 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  26.81 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.86 
 
 
424 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
406 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  25.56 
 
 
414 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  28.81 
 
 
424 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  28.19 
 
 
423 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  27.8 
 
 
428 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
442 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  26.73 
 
 
457 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  25.8 
 
 
418 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  25.95 
 
 
437 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>