More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4618 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  100 
 
 
426 aa  809    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  66.98 
 
 
422 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  64.42 
 
 
408 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  57.48 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  52.93 
 
 
436 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  53.37 
 
 
426 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  48.92 
 
 
445 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  46.52 
 
 
443 aa  345  8.999999999999999e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  47.37 
 
 
415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 
423 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 
443 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  44.23 
 
 
419 aa  285  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  43.88 
 
 
449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  44.36 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  47.14 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  42.69 
 
 
430 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  42.34 
 
 
450 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 
427 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  32.85 
 
 
420 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 
422 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  31.94 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  32.43 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  34.04 
 
 
431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
426 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  30.6 
 
 
415 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
388 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  30.12 
 
 
524 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  30.38 
 
 
415 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  37.1 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
445 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  31.07 
 
 
426 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  30.83 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  30.35 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 
412 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  30.51 
 
 
424 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
422 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  29.87 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  28.57 
 
 
419 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  31.44 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  29.09 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  31.85 
 
 
403 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  29.53 
 
 
418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  30.36 
 
 
406 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
401 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
432 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
432 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  29.76 
 
 
409 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
416 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  25.12 
 
 
427 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 
433 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  29.02 
 
 
412 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
406 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  29.51 
 
 
406 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  27.31 
 
 
451 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
406 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
417 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  24.94 
 
 
424 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  26.72 
 
 
403 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  24.43 
 
 
410 aa  104  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  24.73 
 
 
403 aa  103  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  30.73 
 
 
421 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  27.62 
 
 
423 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
415 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
420 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  31.15 
 
 
360 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.06 
 
 
436 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
411 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  29.07 
 
 
420 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.37 
 
 
418 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
442 aa  99.8  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  27.97 
 
 
413 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  29.95 
 
 
424 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  29.58 
 
 
424 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.82 
 
 
474 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  29.04 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  25.55 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
440 aa  97.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  28.01 
 
 
499 aa  96.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
420 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  28.84 
 
 
403 aa  96.3  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.82 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  30.4 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  29.77 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.25 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.67 
 
 
457 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  28.82 
 
 
416 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  28.98 
 
 
443 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  27.31 
 
 
429 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  27.89 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  29.87 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>