More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2137 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  100 
 
 
424 aa  806    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  59.9 
 
 
406 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  59.9 
 
 
406 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  57.04 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  52.76 
 
 
403 aa  398  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  52.45 
 
 
422 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  52.48 
 
 
440 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  57.04 
 
 
432 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  57.04 
 
 
432 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  55.39 
 
 
479 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  52.88 
 
 
415 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  54.66 
 
 
420 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  55.44 
 
 
406 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  52.83 
 
 
419 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  60.45 
 
 
360 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  57.14 
 
 
424 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  53.32 
 
 
408 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  53.1 
 
 
405 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  52.45 
 
 
409 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  52.74 
 
 
406 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  54.86 
 
 
420 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  53.18 
 
 
451 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  52.74 
 
 
406 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  52.74 
 
 
406 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  53.23 
 
 
403 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  53.64 
 
 
416 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  52.24 
 
 
412 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  54.48 
 
 
416 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  53.03 
 
 
416 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  54.23 
 
 
416 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  54.23 
 
 
416 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  53.03 
 
 
416 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  52.24 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  51.8 
 
 
418 aa  354  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  51.26 
 
 
412 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  53.69 
 
 
410 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  52.57 
 
 
411 aa  346  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  53.9 
 
 
408 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  53.4 
 
 
408 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  53.4 
 
 
408 aa  341  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  49.51 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  53.92 
 
 
415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  54.04 
 
 
416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  53.88 
 
 
404 aa  332  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  48.74 
 
 
421 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  53.25 
 
 
397 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  50 
 
 
423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  46.73 
 
 
415 aa  319  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  46.42 
 
 
416 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  44.29 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  45.16 
 
 
427 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 
411 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 
412 aa  306  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  50 
 
 
421 aa  305  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  45.95 
 
 
454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  47.89 
 
 
429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  47.73 
 
 
457 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  46.6 
 
 
410 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  44.81 
 
 
413 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  45.2 
 
 
403 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  48.34 
 
 
455 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  46.57 
 
 
414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  44.93 
 
 
413 aa  282  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  40.99 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  43.48 
 
 
427 aa  273  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  42.89 
 
 
399 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  41.26 
 
 
401 aa  268  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  37.62 
 
 
424 aa  266  7e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 
401 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  42.3 
 
 
437 aa  263  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  42.86 
 
 
421 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  45.98 
 
 
412 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  41.41 
 
 
407 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  41.97 
 
 
427 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  38.42 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  40 
 
 
410 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  40.44 
 
 
499 aa  239  5.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
416 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 
427 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  38.86 
 
 
414 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
415 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 
418 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  38.24 
 
 
418 aa  230  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 
425 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
414 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
428 aa  209  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  36.98 
 
 
415 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  37.81 
 
 
524 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  35.46 
 
 
415 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  36.45 
 
 
431 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
412 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
447 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  32.63 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  35.06 
 
 
430 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  31.9 
 
 
426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
432 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.48 
 
 
474 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  34.38 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>