More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61170 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  96.28 
 
 
403 aa  745    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  100 
 
 
403 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  80.94 
 
 
412 aa  631  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  79.85 
 
 
406 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  79.6 
 
 
406 aa  620  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  79.85 
 
 
406 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  79.1 
 
 
409 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  57.91 
 
 
415 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  53.35 
 
 
422 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  53.92 
 
 
403 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  59.18 
 
 
406 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  55.2 
 
 
419 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  58.02 
 
 
424 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  55.03 
 
 
406 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  53.79 
 
 
451 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  57.25 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  57.25 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  53.73 
 
 
416 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  53.73 
 
 
416 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  53.4 
 
 
420 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  53.09 
 
 
416 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  55 
 
 
479 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  53.6 
 
 
416 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  52.12 
 
 
405 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  53.6 
 
 
420 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  53.1 
 
 
416 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  53.1 
 
 
416 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  52.76 
 
 
440 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  51.76 
 
 
408 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  53.83 
 
 
418 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  54.98 
 
 
415 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  56.7 
 
 
397 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  53.42 
 
 
408 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  53.42 
 
 
408 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  53.16 
 
 
408 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  51.61 
 
 
406 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  50.87 
 
 
421 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  53.27 
 
 
416 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  51.36 
 
 
406 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  55.08 
 
 
360 aa  355  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  54.16 
 
 
421 aa  355  8.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 
411 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 
416 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  52.99 
 
 
404 aa  344  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  52.56 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
412 aa  341  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 
412 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  51.51 
 
 
411 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  44.3 
 
 
415 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  46.65 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  53.23 
 
 
424 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  47.29 
 
 
428 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  50.37 
 
 
423 aa  322  8e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  48.86 
 
 
413 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  46.33 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  43.03 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  45.7 
 
 
454 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  45.91 
 
 
457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  42.43 
 
 
427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  45.27 
 
 
414 aa  291  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  47.67 
 
 
429 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  45.96 
 
 
412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  41.4 
 
 
411 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  44.42 
 
 
499 aa  279  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  45.91 
 
 
455 aa  278  9e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  40.1 
 
 
424 aa  277  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  40.81 
 
 
414 aa  272  8.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  42.51 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  42.46 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 
401 aa  265  8e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  40.9 
 
 
418 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  41.92 
 
 
427 aa  262  6.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
425 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  39.65 
 
 
427 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  42.34 
 
 
427 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 
415 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  42.06 
 
 
407 aa  257  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 
427 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  41.07 
 
 
401 aa  255  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  43.51 
 
 
421 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  42.96 
 
 
437 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  40.4 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 
416 aa  236  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 
418 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 
428 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  37.4 
 
 
415 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 
414 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  35.82 
 
 
415 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  38.42 
 
 
524 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  35.09 
 
 
431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  32.2 
 
 
474 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  31.47 
 
 
418 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 
422 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
445 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
426 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  29.09 
 
 
415 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  31.37 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>