More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1572 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  805    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  83.82 
 
 		 524 aa  664    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 415 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  39.8 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  38.28 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 413 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 421 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  36.2 
 
 		 415 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  33.49 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 411 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.88 
 
 		 419 aa  206  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  37.92 
 
 		 424 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 418 aa  203  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  37.4 
 
 		 403 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 415 aa  202  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  37.24 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 422 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 409 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  36.11 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  34.36 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 451 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 499 aa  196  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 432 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  36.6 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 408 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 408 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 437 aa  189  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  34.69 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  31.3 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  34.94 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  35.4 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  35.32 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 420 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  36.2 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 406 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  33.93 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  34.85 
 
 		 408 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 421 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 449 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  34.7 
 
 		 404 aa  177  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 416 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 401 aa  176  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  35.77 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  33.5 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  34.65 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  35.24 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  36.22 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  32.76 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 414 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  31.72 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  30.58 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>