More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3166 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3166  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610941  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  67.61 
 
 		 405 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  62.3 
 
 		 408 aa  225  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 		 406 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  46.59 
 
 		 406 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  48.62 
 
 		 420 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  49.72 
 
 		 420 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 451 aa  151  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 		 440 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  47.25 
 
 		 415 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 416 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  45.21 
 
 		 416 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 416 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  46.78 
 
 		 419 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  45.64 
 
 		 416 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  45.64 
 
 		 416 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 416 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  48.8 
 
 		 406 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  48.8 
 
 		 406 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  48.8 
 
 		 409 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  41.8 
 
 		 403 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  54.01 
 
 		 360 aa  138  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 406 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  41.27 
 
 		 403 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  46.49 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 406 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  46.63 
 
 		 412 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 432 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 432 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 		 416 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 403 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  48 
 
 		 479 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 421 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  42.7 
 
 		 412 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 424 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 411 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  43.01 
 
 		 415 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  40 
 
 		 413 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 418 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 415 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 408 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 408 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 408 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 406 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  40 
 
 		 423 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  42.58 
 
 		 404 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 		 422 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  46.67 
 
 		 424 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  40.12 
 
 		 413 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 421 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 		 412 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 428 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 		 397 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  35.33 
 
 		 433 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 414 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 437 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  39.88 
 
 		 410 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  34.59 
 
 		 427 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 401 aa  95.1  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 411 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 401 aa  91.7  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 412 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  37.13 
 
 		 454 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  36.31 
 
 		 410 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 427 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 427 aa  88.2  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  34.78 
 
 		 421 aa  88.2  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 411 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 429 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  33.75 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  34.64 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  31.37 
 
 		 418 aa  78.6  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  35.48 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 442 aa  75.5  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 499 aa  75.1  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 418 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 426 aa  72  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 474 aa  72  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 436 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>