More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3253 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 		 533 aa  1049    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  48.74 
 
 		 542 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  49.51 
 
 		 542 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  45.75 
 
 		 542 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  48.54 
 
 		 542 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  47.07 
 
 		 541 aa  435  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  48.07 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  45.95 
 
 		 543 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 541 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  48.93 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  49.13 
 
 		 561 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  44.18 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  44.08 
 
 		 544 aa  360  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  41.19 
 
 		 562 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  40.96 
 
 		 562 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  38.15 
 
 		 543 aa  316  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  35.55 
 
 		 535 aa  306  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  36.5 
 
 		 532 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  35.45 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  39.96 
 
 		 560 aa  297  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  39 
 
 		 555 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  41.38 
 
 		 562 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  35.09 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  37.31 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  37.45 
 
 		 529 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  34.38 
 
 		 532 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  38.4 
 
 		 549 aa  286  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  36.79 
 
 		 526 aa  283  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  38.57 
 
 		 519 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  39.68 
 
 		 535 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  37.31 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  34.1 
 
 		 571 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  34.17 
 
 		 572 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  37.33 
 
 		 569 aa  279  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  37.33 
 
 		 569 aa  279  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  35.7 
 
 		 539 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  37.35 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  42.86 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  35.82 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  37.04 
 
 		 542 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  35.32 
 
 		 586 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  38.42 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  36.02 
 
 		 560 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  36.83 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  34.38 
 
 		 532 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  37.02 
 
 		 535 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  35.4 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  35.67 
 
 		 539 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  45 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  36.77 
 
 		 528 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  34.51 
 
 		 539 aa  256  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  35.55 
 
 		 542 aa  253  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  35.84 
 
 		 574 aa  252  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  33.9 
 
 		 527 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  36.15 
 
 		 533 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  35.77 
 
 		 533 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  35.77 
 
 		 533 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  34.05 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  36.63 
 
 		 541 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  33.33 
 
 		 536 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  34.96 
 
 		 532 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  37.91 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  37.91 
 
 		 433 aa  203  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  37.91 
 
 		 433 aa  203  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  37.66 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  37.66 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  37.66 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  37.66 
 
 		 429 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  37.66 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 442 aa  144  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  29.23 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 428 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  30.53 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.97 
 
 		 413 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  30.43 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 447 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.74 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 457 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  26.09 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.95 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 417 aa  120  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  31.78 
 
 		 414 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>