More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2578 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  99.54 
 
 		 433 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  99.54 
 
 		 433 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  99.53 
 
 		 429 aa  828    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  100 
 
 		 433 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  99.54 
 
 		 433 aa  837    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  92.38 
 
 		 433 aa  722    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  100 
 
 		 433 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  99.77 
 
 		 433 aa  839    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  39.61 
 
 		 542 aa  264  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  39.36 
 
 		 542 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  42.07 
 
 		 551 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  41.56 
 
 		 557 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  38.26 
 
 		 541 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  39.61 
 
 		 542 aa  249  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  37.72 
 
 		 542 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  41.77 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  41.37 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  41.01 
 
 		 543 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  34.95 
 
 		 572 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  39.33 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  38.71 
 
 		 544 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  34.95 
 
 		 571 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  42.18 
 
 		 562 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  38.48 
 
 		 553 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  37.87 
 
 		 553 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  41.21 
 
 		 560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  36.7 
 
 		 535 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  35.79 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  37.47 
 
 		 560 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  40.21 
 
 		 543 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  38.15 
 
 		 535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  37.16 
 
 		 555 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  34.18 
 
 		 532 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  36.29 
 
 		 554 aa  209  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  39.45 
 
 		 541 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  36.2 
 
 		 551 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 541 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  38.74 
 
 		 549 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  38.21 
 
 		 529 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  41.96 
 
 		 529 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  40.2 
 
 		 561 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  37.47 
 
 		 530 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  39.39 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  36.83 
 
 		 526 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  36.06 
 
 		 539 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  34.43 
 
 		 532 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  36.83 
 
 		 533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  36.83 
 
 		 533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  34.82 
 
 		 586 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  36.59 
 
 		 533 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  36.01 
 
 		 539 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  35.05 
 
 		 532 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  35.01 
 
 		 536 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  37.25 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  34.31 
 
 		 539 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  37.94 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  33.41 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  33.42 
 
 		 532 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  35.33 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  35.19 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  35.05 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  34.31 
 
 		 569 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  34.31 
 
 		 569 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  34.88 
 
 		 535 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  35.73 
 
 		 541 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  34.92 
 
 		 542 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  33.77 
 
 		 542 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  31.33 
 
 		 536 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  35.05 
 
 		 574 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 442 aa  141  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 436 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.11 
 
 		 446 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.4 
 
 		 418 aa  126  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.72 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 450 aa  123  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 440 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  27.93 
 
 		 426 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.97 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  28.5 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.2 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  30.08 
 
 		 452 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>