More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0803 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  60.41 
 
 		 541 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 		 544 aa  1083    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  60.37 
 
 		 542 aa  632  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  60.19 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  62.04 
 
 		 542 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  57.14 
 
 		 542 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  60.34 
 
 		 551 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  56.9 
 
 		 543 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  60.45 
 
 		 561 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  59.93 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  59.55 
 
 		 541 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  50.57 
 
 		 557 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  42.99 
 
 		 562 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  43.56 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  40.67 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  42.91 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  38.64 
 
 		 535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  43.41 
 
 		 562 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  44.08 
 
 		 533 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  38.32 
 
 		 560 aa  332  9e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  36.42 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  36.62 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  38.64 
 
 		 551 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  40.7 
 
 		 526 aa  325  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  37.81 
 
 		 543 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  38.23 
 
 		 553 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  39.5 
 
 		 535 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  37.45 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  38.33 
 
 		 539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  38.49 
 
 		 549 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  40.76 
 
 		 535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  34.07 
 
 		 571 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  38.93 
 
 		 529 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  34.07 
 
 		 572 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  36.36 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  36.45 
 
 		 532 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  38.61 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  38.3 
 
 		 549 aa  297  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  43.65 
 
 		 419 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  38.55 
 
 		 528 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  40.61 
 
 		 529 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  35.63 
 
 		 539 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  38.68 
 
 		 542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  37.05 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  37.43 
 
 		 539 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  46.72 
 
 		 409 aa  280  7e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  37.77 
 
 		 536 aa  279  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  36.65 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  37.26 
 
 		 536 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  36.31 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  37.28 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  37.28 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  36.9 
 
 		 533 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  33.33 
 
 		 527 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  35.01 
 
 		 519 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  35.43 
 
 		 569 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  35.43 
 
 		 569 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  33.53 
 
 		 542 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  37.03 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  33.27 
 
 		 532 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  36.38 
 
 		 541 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  34.62 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  38.46 
 
 		 433 aa  230  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  38.46 
 
 		 433 aa  230  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  38.46 
 
 		 433 aa  230  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  38.46 
 
 		 429 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  38.71 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  38.71 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  38.46 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 436 aa  156  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 442 aa  152  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  28.04 
 
 		 430 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  31.4 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  30.81 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 412 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 423 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 417 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 407 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 450 aa  136  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  25.58 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  30.59 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.57 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 494 aa  131  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  28.35 
 
 		 429 aa  130  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>