More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4414 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  100 
 
 		 557 aa  1107    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  53.93 
 
 		 542 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  56.6 
 
 		 551 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  54.01 
 
 		 541 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0311  transporter, putative  54.3 
 
 		 542 aa  535  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.054545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3361  protein of unknown function DUF894 DitE  54.88 
 
 		 542 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0287  putative transporter  54.11 
 
 		 542 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4071  protein of unknown function DUF894 DitE  55.03 
 
 		 543 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2969  protein of unknown function DUF894, DitE  56.02 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.207712 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0945  major facilitator transporter  55.45 
 
 		 541 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2604  protein of unknown function DUF894, DitE  55.45 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0803  protein of unknown function DUF894, DitE  50.57 
 
 		 544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0118  hypothetical protein  48.67 
 
 		 562 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0685  protein of unknown function DUF894, DitE  48.29 
 
 		 562 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.667795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0448  protein of unknown function DUF894, DitE  46.53 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0090  protein of unknown function DUF894 DitE  49.53 
 
 		 562 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0278  major facilitator superfamily permease  47.51 
 
 		 560 aa  392  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  39.22 
 
 		 554 aa  350  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3253  protein of unknown function DUF894, DitE  44.18 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373  normal  0.254586 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  41.31 
 
 		 526 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  39.77 
 
 		 560 aa  342  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  38.62 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  39.76 
 
 		 532 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  38.33 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  39.58 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  38.62 
 
 		 528 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  40.58 
 
 		 543 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  39.88 
 
 		 551 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  46.52 
 
 		 419 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  40.27 
 
 		 529 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  38 
 
 		 586 aa  323  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  36.38 
 
 		 571 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  36.38 
 
 		 572 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5161  protein of unknown function DUF894, DitE  38.33 
 
 		 532 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0839068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  38.89 
 
 		 530 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  40.24 
 
 		 549 aa  312  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  38.58 
 
 		 542 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  38.09 
 
 		 553 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  37.69 
 
 		 553 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  39.8 
 
 		 539 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5315  putative major facilitator superfamily transporter  37.94 
 
 		 539 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00425912  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  35.99 
 
 		 535 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  45.95 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5468  protein of unknown function DUF894 DitE  38.18 
 
 		 535 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  38.77 
 
 		 569 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  38.74 
 
 		 569 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0225  protein of unknown function DUF894, DitE  39.34 
 
 		 533 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.383838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0235  protein of unknown function DUF894, DitE  39.34 
 
 		 533 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  38.24 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2332  protein of unknown function DUF894 DitE  39.65 
 
 		 549 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0975452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0215  protein of unknown function DUF894, DitE  39.15 
 
 		 533 aa  286  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155573  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4092  protein of unknown function DUF894, DitE  36.8 
 
 		 519 aa  284  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  36.49 
 
 		 539 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  36.11 
 
 		 536 aa  280  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  41 
 
 		 529 aa  280  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  35.55 
 
 		 527 aa  280  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  37.93 
 
 		 574 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4167  protein of unknown function DUF894, DitE  36.1 
 
 		 532 aa  273  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  37.72 
 
 		 549 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  37.95 
 
 		 542 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1954  hypothetical protein  42.32 
 
 		 433 aa  253  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3144  MFS family transporter  35.59 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631195  normal  0.502456 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1414  hypothetical protein  41.81 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2139  hypothetical protein  41.81 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3174  hypothetical protein  41.81 
 
 		 433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.932461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1637  hypothetical protein  41.81 
 
 		 429 aa  246  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2524  major facilitator family transporter  41.81 
 
 		 433 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2578  major facilitator family transporter  41.56 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.909928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2666  MFS permease  41.56 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 453 aa  157  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 412 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  33.52 
 
 		 418 aa  148  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 474 aa  146  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 410 aa  144  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  28.12 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 436 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  30.96 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 450 aa  138  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.52 
 
 		 430 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 405 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 450 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.78 
 
 		 431 aa  134  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 426 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>