More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1728 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  799    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 414 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  42.96 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 408 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 		 430 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 		 414 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 420 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 432 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 436 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 432 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 420 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.38 
 
 		 414 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.13 
 
 		 414 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  24.62 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 406 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  28.03 
 
 		 408 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  27.54 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  26.96 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  27.54 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.46 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  27.63 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  27.63 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  27.63 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.2 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.2 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  30.13 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.63 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.47 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.2 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  25.61 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  28.27 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  25.25 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  25.25 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  30.1 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  27.85 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  27.85 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  27.85 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  30.1 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  27.85 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  27.85 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  30.05 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.65 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.37 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.75 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  24.75 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  27.85 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>