163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2477 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  804    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  59.8 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  53.98 
 
 		 437 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  33.45 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 420 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.72 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21960  Major Facilitator Superfamily transporter  33.33 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2652  transmembrane efflux protein  57.14 
 
 		 168 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 428 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  28 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  23.65 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  23.65 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  23.39 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  28.47 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  23.47 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  30.91 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  27.03 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  27.43 
 
 		 528 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  28.27 
 
 		 535 aa  59.7  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  28.32 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  28.32 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  26.48 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  28.32 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  28.69 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  28.69 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  24.88 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.85 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  28.69 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  23.68 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  29.95 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  26.79 
 
 		 532 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  28.69 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  28.69 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  28.69 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  24.49 
 
 		 730 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  26.32 
 
 		 686 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  24.24 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  21.34 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  26.87 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  21.65 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  25.93 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  25.93 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  21.39 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  24.79 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>