More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1932 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
406 aa  796    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  24.63 
 
 
406 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.62 
 
 
406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.56 
 
 
404 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  23.56 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  24.14 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  24.14 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  24.14 
 
 
406 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.89 
 
 
404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  31.02 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  22.31 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  29.37 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.63 
 
 
408 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  26.91 
 
 
408 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  26.91 
 
 
408 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.91 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  27.2 
 
 
408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  30.5 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.99 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.63 
 
 
408 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.61 
 
 
420 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  28.35 
 
 
420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  28.35 
 
 
420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.35 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  28.61 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.22 
 
 
405 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.22 
 
 
405 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.38 
 
 
1833 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  28.84 
 
 
413 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  28.84 
 
 
413 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
441 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  34.5 
 
 
209 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
429 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  34.25 
 
 
420 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.02 
 
 
474 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
444 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.37 
 
 
413 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  26.79 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.02 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  23.02 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  23.02 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.02 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.02 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.02 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  22.72 
 
 
415 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.6 
 
 
432 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  25.61 
 
 
438 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  27.8 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  25.63 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  23.42 
 
 
1816 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  26.04 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  27.01 
 
 
413 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.15 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.15 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  21.98 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  26.18 
 
 
416 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  23.92 
 
 
445 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 
421 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  25.69 
 
 
416 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  25.89 
 
 
425 aa  90.1  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  26.19 
 
 
418 aa  90.1  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.68 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  23.02 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  26.76 
 
 
427 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  20.74 
 
 
405 aa  89.7  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  23.51 
 
 
415 aa  89.4  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  23.3 
 
 
426 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  25.85 
 
 
427 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  24.2 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  24.36 
 
 
425 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
450 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.01 
 
 
430 aa  87  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 
411 aa  86.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.69 
 
 
424 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  25.32 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  26.77 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  31.69 
 
 
417 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  26.07 
 
 
448 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  27.48 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3278  major facilitator transporter  23.92 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.33 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
432 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  25.69 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  27.75 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>