More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0985 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  909    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  54.27 
 
 
547 aa  445  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  53.99 
 
 
482 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  53.99 
 
 
482 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  53.35 
 
 
543 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  51.48 
 
 
462 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  52.7 
 
 
486 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  56.84 
 
 
522 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5239  major facilitator superfamily MFS_1  48.39 
 
 
459 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  43.41 
 
 
420 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  44.44 
 
 
459 aa  296  4e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  41.74 
 
 
471 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  40.71 
 
 
415 aa  284  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  41.71 
 
 
460 aa  266  8e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  42.48 
 
 
437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  38.39 
 
 
432 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
397 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  26.36 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  26.36 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  26.17 
 
 
901 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  23.62 
 
 
730 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  24.93 
 
 
709 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  26.84 
 
 
686 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 
444 aa  90.5  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  26.68 
 
 
445 aa  90.1  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
401 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.37 
 
 
1136 aa  87  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
421 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  24.49 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.04 
 
 
415 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.04 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  23.04 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  22.98 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.04 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.04 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.47 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
727 aa  83.2  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  23.23 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  22.98 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  25.37 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  22.98 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  24.25 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  24.25 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.47 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.67 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.78 
 
 
1128 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  23.23 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  22.73 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24.22 
 
 
404 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  23.1 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  23.67 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  26.03 
 
 
686 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.67 
 
 
419 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  24.48 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 
404 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  24.48 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.7 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.19 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  25.76 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  22.84 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  25.83 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.76 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  24.27 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  25.25 
 
 
499 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.42 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.54 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.42 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  22.25 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  21.84 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  21.19 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  21.19 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  23.22 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.26 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  24.31 
 
 
688 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  20.92 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  23.72 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.76 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  26.68 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
725 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  22.67 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.9 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 
453 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2776  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.82 
 
 
1129 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.97 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  22.67 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  23.19 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  22.32 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>