More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5360 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 430 aa  841    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  28.53 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8128  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 512 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.18 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.53 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.69 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  27.43 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.91 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.91 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  23.62 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.69 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  24.69 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.02 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  30 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  19.84 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  19.84 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  26.87 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  26.87 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  26.87 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  25.85 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  22.22 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  22.3 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.08 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  28.73 
 
 		 686 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  28.41 
 
 		 688 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  27.01 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  28.38 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.73 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  23.14 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24170  arabinose efflux permease family protein  24.09 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.917707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  24.89 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  30.57 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>