More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24170 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24170  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 405 aa  791    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.917707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  30 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  26.48 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  27.48 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  27.48 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  27.15 
 
 		 417 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  27.15 
 
 		 415 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  27.15 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  25.96 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  25 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  22.01 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  22.19 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  22.01 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  21.45 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  21.45 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  21.45 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  21.45 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  21.45 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.55 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.65 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.55 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.73 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  24.32 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.19 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.19 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.58 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  21.17 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  25.3 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  25.45 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  25.45 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  23.61 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.16 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  25.81 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  25.45 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 441 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  26.22 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.82 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  25.81 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  23.1 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.97 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0918  major facilitator superfamily permease  24.48 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8128  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  22.55 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  22.43 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1780  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  23.45 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  23.45 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  22.76 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  23.04 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.09 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>