More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8128 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8128  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 512 aa  998    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 427 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  31.06 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 430 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 451 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 436 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 418 aa  87.4  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.54 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  19.74 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  30.12 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  30.72 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  19.74 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  23.72 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  31.58 
 
 		 420 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  30.72 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  30.99 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.63 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  29.52 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.68 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  24.87 
 
 		 411 aa  67  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  25 
 
 		 441 aa  67  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  29.22 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  20.97 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.17 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.17 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.17 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 416 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 416 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.22 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  23.47 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 408 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24170  arabinose efflux permease family protein  25.98 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.917707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  28.05 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  27.96 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  28.05 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  26.43 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.61 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 442 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.76 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  27.85 
 
 		 419 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  23 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>