More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4378 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  824    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  60 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  36.25 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 408 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 420 aa  189  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 		 433 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 414 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 441 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 415 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 412 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 423 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 420 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.59 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.36 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.65 
 
 		 414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 417 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 450 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.49 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  30.03 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.54 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.3 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.82 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.3 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.3 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.3 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.3 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  28.86 
 
 		 408 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  24.34 
 
 		 406 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  25.78 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.73 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  25 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  24.34 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  25.52 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  25.52 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  25 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 417 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  26.25 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  25.59 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 434 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 417 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.26 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  24.22 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.04 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.04 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.04 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  25.07 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  26.51 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  25.07 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  30.08 
 
 		 460 aa  91.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.87 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.45 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.41 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  26.76 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 467 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.4 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 499 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.12 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0033  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  87  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 440 aa  86.7  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>